Quatre amis du collège Kadic ont découvert dans une usine désaffectée un ordinateur qui génère un monde virtuel, Lyoko, et ont fait connaissance avec l'humanoïde Aelita, seule habitante de Lyoko. Le virus Xana a pris le contrôle de l'ordinateur et menace Lyoko et la Terre. Suite à des phénomènes mystérieux Yumi, Ulrich, Odd et Jeremy sont persuadés qu'ils sont le fait de Xana...
